1999年(nián )，某(🆓)个东(✒)西被卡车(📒)运出了馆山(shān )(🌰)市。几天(🕟)后，哥斯(sī )拉登陆了(🎺)馆山，特(🆖)生自卫(wèi )队(duì )出动与之展开(🥩)了苦战。在(zài )(🌫)战斗中(🎲)，自卫队员(♑)家城(😎)茜（釈(⚫)由美(měi )子 饰）意(yì )外害死了(le )战友叶山二尉（(🛹)森末慎(🚥)二(🐖) 饰），自己(🥞)却侥幸活了下(😻)来，并(🚑)被派(pài )去了(🤯)资(zī )(😱)料科。　　另一方面，日本政府在柘植真智子首相（水(shuǐ )野(🎛)久美 饰）的指(🙂)挥下，召(zhào )集了(le )汤(🤠)原(🤸)德光(guāng )(🙄)（宅麻(🙀)伸 饰）等科学家开始(shǐ )研(yán )究对付哥斯(🕙)拉(⛳)的G兵器(qì )。他们(men )以(🥕)在馆(guǎn )山冲挖(wā )掘出来的(🌮)初代哥斯拉骨(💝)骼(gé )为基(🏉)础(chǔ )，用(yòng )了四年(nián )制成(🦇)了机(jī )械哥斯(sī )拉—(⛏)—3式机(jī )龙。柘植首相辞职(zhí )，由科(🔈)学技术厅长(zhǎng )官(guān )五(wǔ )十(📧)岚(lán )隼人（中尾彬 饰）就任(rèn )新首相。同时(shí )，茜被派去(🔎)了机(🔙)龙队，担任(rèn )机(jī )龙(💣)的操作员。　　就在准(zhǔn )(🔲)备(👛)机龙测试(🎦)机动时，哥斯拉又在东京湾出现了。机龙赶(😉)赴(🚤)现(xiàn )场与哥(gē )斯拉(lā )对战(⏺)，却因(yīn )哥斯拉(🔬)的吼声唤醒了体内的野兽(👼)灵(líng )魂，突然(✒)暴走，在(zài )城市中造成了大破坏。　　为(wéi )(🗒)了改良机龙，汤原改变(biàn )(🍈)了机(jī )龙DNA计(jì )算(suàn )机(jī )的碱构(gòu )造(zào )，使机(jī )龙(🤠)不会再(zài )受(shòu )哥斯拉(🐼)叫声的干扰。但由于对再次暴走的担忧，五(wǔ )十岚迟迟不允(yǔn )(❗)许出动机龙。　　哥斯(📛)拉再度出(chū )(🥈)现在(zài )东京湾，一路(📒)无视特生自(💽)卫队的攻击来(lái )(🆕)到了品(💓)川(chuān )(🛒)，令城(💦)市变成了一片(piàn )火海。面对如(🕶)此情景(jǐng )，五十岚终(zhōng )于同意让机龙出(🐔)动。　　(🐊)为(wéi )了(🏈)打败哥斯拉(lā )，机龙(💙)被送到了品川。茜也抱(🤯)着必死的觉悟。机龙和茜(💼)的(de )战(🌻)斗就这样开(kāi )始了。