第二集中，尼奥（基(jī )努·里(📼)维斯 Keanu Reeves 饰）没有能从(🆖)内部(bù )摧毁“母体(🏴)”，他(tā )的身体在真实世界的飞(fēi )船上陷于昏迷，思(⚫)想却被(🔸)困在介于“母(🎡)体”和真实世(shì )界的中间(jiān )地带(🚥)，这个地方由“火车(😚)人”控制。墨菲斯（(🥀)劳(láo )伦斯·菲什(🔊)伯(💞)恩 Laurence Fishburne 饰）和崔妮蒂(dì )(🗞)（(🙂)凯瑞(ruì )-安·莫斯 Carrie-Anne Moss 饰）等人知道了(le )(💠)尼奥(⛳)的(de )情况，在守(🐀)护天使的带领下， 找(🤘)到了“火车人”的(de )控(kòng )制(zhì )(🛎)者梅罗纹奇，经过一番激斗，将(jiāng )尼(🤷)奥救(jiù )了出来。　　此(cǐ )时(shí )，电子(zǐ )乌贼部队(🈺)对锡(📧)安发起了(le )猛烈(liè )的(👌)攻击(jī )，人类组织(zhī )(💸)所(suǒ )有机甲战(zhàn )(🔞)士展开顽强的(🔙)抵抗(kàng )(👄)，形势(🖍)危在旦夕；尼(📞)奥(⏳)和崔妮(nī )蒂驾(🔲)驶(👛)了(🕕)一艘飞船克服(fú )重重困(kùn )难，到(dào )达(dá )(🧘)机(jī )器城市(📬)，尼(ní )奥终于见(jiàn )到了机器(🏸)世界的统治(zhì )者(zhě )(🔮)“机器大(dà )帝”，双方谈(🚪)判并达成了协(😲)议：尼(🏡)奥(ào )除掉不受(🛃)“母体”控制的(🐇)史密斯，以(yǐ )换取锡安(ān )的和平。　　在“母体”中(🔮)，尼奥和史(🏁)密斯(😻)展开(kāi )了关系人(rén )类生(😂)死(sǐ )存亡的最后决斗。